課程資訊
課程名稱
結構生物學與生物資訊特論
Structural Biology & Bioninformatics 
開課學期
101-1 
授課對象
生物資源暨農學院  生物科技研究所  
授課教師
楊啟伸 
課號
Biot8003 
課程識別碼
642ED0040 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期五5,6,7(12:20~15:10) 
上課地點
生技館212 
備註
本課程以英語授課。與蔡孟勳合開
限博士班
總人數上限:20人
外系人數限制:15人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1011_iob_sb 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

本課程之教學目標,在於使學生對現代結構生物學之內容、重要性和其未來發展,有一較為全面而完整的認識。鑑於在最近的生命科學發展中,約略是以生命生理、結構生物、生命作用動態分析、生物資訊以及生命科技應用為五大發展方向。而就此目前之發展趨勢來說來分析,其中以結構生物和任何其它四個發展方向結合,已成為追求更深入之生命知識和科技研究的主要潮流之一。
本校目前有開結構生物學概論,是一類似但目標不相同的課程,另有蛋白質結構與弁� (P05 U3230)。而與本課程部分內容將會和生物物理學 (B02 30100), 蛋白質體學 (P05 U9120) 以及生物資訊學 (P05 U9140)有關連。本課程在教學內容設計上,是以結構生物領域之整體觀念為主要,並深入探討每一個主題的最近發展,以理論、研究方法以及實際成巨狺l的三合一角度來引導學生對結構生物的深入認識。學生修畢之後,對於最新的結構生物學的認識,將有十分正面之效果。 

課程目標
本課程之目的,在於藉由結合理論、研究方法(包括重要結構生物電腦軟體之學習和使用)和在每一個主題中的多個經典之成幼蚳狳虒挭懇硎c生物學,使研究所學生,可以有系統地熟悉結構生物學之實質研究內容和方法,並對結構生物學之優點和貢獻有完整而清晰之認識。 
課程要求
先修課程:生物化學 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目
1. David Whitford (2005). Proteins : Structure and Function. John Wiley & Sons, Hoboken, NJ. USA.
2. Gregory A. Petsko and Dagmar Ringe (2003). Protein Structure and Function, 4th ed., New Science Press, Waltham, MA.
3. 教學內容也以科學期刊而隨時更新。 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
一次期末考 
30% 
 
2. 
一份軟體使用報告書 
20% 
 
3. 
一次配合教學,自選主題分組報告 
20% 
 
4. 
一次期中考 
30% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
Week 1
  Introduction to structural biology 
Week 2
  A look at the amino acids in structural biological ways.  
Week 3
  The basic blocks of protein structures: Alpha-helix, Beta-sheet, Beta-turns, Beta-bulge, Loops.

Available software for PDB file display. 
Week 4
  1. Protein functions within cells.
2. Five basic protein structural domains.
3. Protein physiological functions. 
Week 5
  1. Protein functional domains
2. Methods for structural resolving 
Week 6
  Methods for structural resolving: X-ray diffraction 
Week 7
  Meeting break 
Week 8
  1. Methods for structural resolving: CryoEM and Other methods.
2. Software usage demonstration 
Week 9
  Midterm Exam 
Week 10
  1. Structural Biology and Life Science
2. Student presentation 
Week 11
11/16  Introduction of Bioinformatics 
Week 12
  Introduction of Microarray 
Week 13
  Gene expression microarray analysis  
Week 14
  NTUMAPs demo 
Week 15
  SNP analysis 
Week 16
  copy number variation 
Week 17
  Next generation sequencing 
Week 18
  Final examination